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银行扣的短信费可以开发票。

银行收取的短信服务费属于有偿服务收费，银行开票规定，相关的服务费用在开票系统中会单独列示，凭交易凭证或交易记录等证明材料是可以向银行索要相应发票的，银行扣的短信费可以开具发票，不过，早期银行开票并不规范，存在有的银行只能提供收据而非发票的情况，但随着相关规定的完善，现在银行收取短信费已经能够提供发票作为凭证了，如果需要开具短信费的发票，建议携带有效身份证件以及交易凭证或交易记录等材料前往银行柜台进行办理，至于具体的开票流程或规定，可能会因不同的银行而有所不同，可以咨询银行客服获取更详细的信息。

仅供参考，建议咨询银行工作人员获取更全面准确的信息。